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[建模与可视化]
求助如何绘制美观的分子结构图
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楼主
发表于 Post on 2021-4-9 09:45:26
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|只看大图 View big picture
|倒序浏览 Reverse view
|阅读模式 Reading model
本人在文献阅读中发现了这样的分子结构图
1.png (19.93 KB, 下载次数 Times of downloads: 73)
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2021-4-9 09:44 上传 Uploaded
,觉得挺美观;所以想请教一下各位老师借助GaussView绘制并对其优化后的结构图怎样处理才能达到那样的效果呢?
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mitsks
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发表于 Post on 2021-4-9 09:49:58
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看起来像MS里的风格
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发表于 Post on 2021-4-9 09:55:15
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VMD估计也可以吧
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lyj714
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发表于 Post on 2021-4-9 09:56:03
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vmd做出来的比这更好看。。。
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楼主 Author|
发表于 Post on 2021-4-9 10:20:28
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lyj714 发表于 2021-4-9 09:56
vmd做出来的比这更好看。。。
感谢回复,新手求助如何将优化好的输出文件或.fch文件进行转化才能让其用VMD打开呢?
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楼主 Author|
发表于 Post on 2021-4-9 10:39:42
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wwangyt@tju.edu 发表于 2021-4-9 10:20
感谢回复,新手求助如何将优化好的输出文件或.fch文件进行转化才能让其用VMD打开呢?
查到了,保存为,pdb文件即可
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niobium
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发表于 Post on 2021-4-9 11:45:19
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这应该是CYLView 2.0画的
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sobereva
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发表于 Post on 2021-4-10 00:15:06
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GaussView产生不了相同效果
CYLView可以画出来更好看的
使用CYLview绘制高质量分子结构图和制作化学反应演示动画(视频演示)
http://sobereva.com/453(http://bbs.keinsci.com/thread-11760-1-1.html)
也建议考虑ChimeraX和SAMSON,默认设置下的显示效果就已经不错,比GaussView强得多。
VMD作图设置极为灵活,可控性极大
北京科音自然科学研究中心(http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。
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